结直肠癌淋巴结转移多模态科研辅助智能体

这是提交到南方医院智能体大赛 Nexent 平台的精简容器发布包。系统以脱敏病例的预提取 CT 影像组学特征、患者级病理特征和四项临床变量为输入，通过固定五成员模型集成输出结直肠癌淋巴结转移风险概率，并生成可审计的科研辅助报告。

本系统仅用于科研辅助和病例复核，不替代病理诊断、治疗建议或临床最终决策。

当前真实能力

• CT：1409 维预提取特征，分为 shape 14、original 93、wavelet 744、transformed 558。
• 病理：患者级 768 维预提取特征。
• 临床：age、male、Type、T。
• 模型：5 个固定成员，部署阈值 0.3529504342004657。
• MCP：6 个固定只读工具，Streamable HTTP 路径为 /mcp。
• 报告：转义 HTML、质量提示、概率、阈值距离、复核优先级和安全声明。

系统不处理原始 DICOM/ROI，不读取或切分 WSI，不运行 ResNet，不生成病理热图，也不提供单特征因果归因。

六工具工作流

1. crc_lnm_get_model_info
2. crc_lnm_case_data_qc
3. crc_lnm_prepare_ct_features
4. crc_lnm_prepare_pathology_features
5. crc_lnm_predict_multimodal
6. crc_lnm_generate_report

每个病例必须使用同一个 UUIDv4 trace_id。任一步失败必须停止，不能跨病例或跨 trace 复用 artifact。

构建与运行

在本目录执行：

docker build -t crc-lnm-mcp:competition .
docker run --rm -p 8000:8000 `
  -e CRC_LNM_MCP_BEARER_TOKEN="<由平台Secret注入>" `
  -e CRC_LNM_MCP_ALLOWED_HOSTS="crc-lnm-mcp:*,localhost:*,127.0.0.1:*" `
  -e CRC_LNM_MCP_ALLOWED_ORIGINS="http://nexent:3000" `
  crc-lnm-mcp:competition

就绪检查：

GET http://127.0.0.1:8000/health/live
GET http://127.0.0.1:8000/health/ready

Nexent 自定义 MCP URL 为 http://<平台分配服务名>:8000/mcp。安全默认配置要求 Authorization: Bearer <secret>；如果平台无法设置 Header，只能在平台隔离内网中改用 configs/mcp.nexent-internal.yaml，禁止暴露公网。

目录

• src/：精简 MCP 推理运行代码。
• models/deployment_bundle/：完整性校验后的真实五成员模型。
• demo/cases/demo_case_001/：不含患者信息的零值合成黄金病例。
• schemas/mcp/v1/：六工具 JSON Schema。
• tests/：发布合同和真实模型回归测试。
• docs/：平台部署、提示词、模型卡、测试报告和提交清单。

详细操作见 平台容器部署说明，Nexent 使用的完整提示词见 智能体系统提示词。